如何使用ncbi搜索并下載基因序列

基因的全序列是么？ OK 進(jìn)入NCBI，選中mapview選擇項(xiàng)。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/ 輸入你要下載的基因名稱(chēng)和物種。 舉個(gè)例子，我要下載小鼠的IGF2基因。 先在下拉菜單中選mus musculus（小鼠的拉丁文）， for后面填寫(xiě)IGF2基因（你要

NCBI是生物學(xué)科經(jīng)常使用的搜索引擎，其收納了大量的基因和蛋白序列，可以對(duì)這些序列進(jìn)行比對(duì)、設(shè)計(jì)引物等，功能非常強(qiáng)大。接下來(lái)以下載H9亞型流感病毒HA基因?yàn)槔秊榇蠹医榻B如何使用NCBI搜索并下載基因序列。

方法

利用瀏覽器搜索NCBI，點(diǎn)擊進(jìn)入官網(wǎng)。

打開(kāi)ncbi網(wǎng)頁(yè)，在最上面的搜索框旁邊的下拉條選擇nucleotide，輸入MC1R（有時(shí)候需要寫(xiě)全稱(chēng)比較準(zhǔn)），點(diǎn)擊“search".然后可以看到搜索到的網(wǎng)頁(yè)的右上角有：Top Organisms [Tree]，再點(diǎn)擊那個(gè)”Tree",可以看到分類(lèi)群的各種不同種屬的數(shù)據(jù)。點(diǎn)哪個(gè)種

進(jìn)入官網(wǎng)后在欄目?jī)?nèi)選擇“Nucleotide”，搜索欄內(nèi)輸入“Avian influenza virus H9 HA”，輸入完畢后點(diǎn)擊“search”。

OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)之父Victor Almon McKusick先生是位臨床醫(yī)生。該數(shù)據(jù)庫(kù)的最原始的版本是一本叫MIM的遺傳學(xué)書(shū)籍，后來(lái)挪到了網(wǎng)上，就加了一個(gè)“O”稱(chēng)為在線(xiàn)的人類(lèi)孟德?tīng)栠z傳學(xué)。所以O(shè)MIM數(shù)據(jù)庫(kù)不同于其他的NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)。其設(shè)計(jì)之初是為臨床醫(yī)生提供在線(xiàn)瀏

新的頁(yè)面會(huì)顯示許多關(guān)于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列，如果其中的一個(gè)符合你的要求，就在它序列前的方框打勾即可。也可以根據(jù)自身需求繼續(xù)在搜索條內(nèi)添加限定，比如添加“2010”，即2010年分離到的病毒。

我現(xiàn)在的文件里有幾百個(gè)基因的ID(EntrezID),怎樣去下載這些ID對(duì)應(yīng)的基因fasta格式的序列?NCBI里有Batchentrez,但是需要的是accession和GI號(hào),我轉(zhuǎn)換完ID之后,都是一

選定目的基因序列后，點(diǎn)擊界面右上角的“send to”，在“choose destination”中選擇“file”,在“format”中選擇“FASTA”，最后點(diǎn)擊“create file”即可將序列下載到自定義文件夾。

GenBank同二樓說(shuō)的，還有DDBJ、EMLB，是世界三大核酸數(shù)據(jù)庫(kù)，三者各有優(yōu)缺點(diǎn)，如果要完整菌種的序列，你可以將三者結(jié)合使用，希望幫到你。

下載完畢后打開(kāi)所在文件夾就能看到基因序列了。

小鼠的可以下載，牛的恐怕暫時(shí)還沒(méi)有 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/mouse/

擴(kuò)展閱讀，以下內(nèi)容您可能還感興趣。

我想在NCBI上下載特定物種的Sox21基因的序列？要怎么操作？

這里zd：內(nèi)容

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Sox21更多追問(wèn)追答追問(wèn)我是想下載它的序列，就是ATGC的那些東西。追答　　你可以點(diǎn)擊那些鏈接啊，或者你說(shuō)具體點(diǎn)，你需要那個(gè)物種的SOX21，要cDNA還是基因組DNA。追問(wèn)我沒(méi)發(fā)現(xiàn)連接里面有具體的序列呀？，要基因組DNA追答哪個(gè)物種的基因組DNA的SOX21?追問(wèn)老鼠，人，猩猩，狗都行追答　　1. 點(diǎn)下面這個(gè)鏈接：

　　http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=refGene&i=NM_007084&c=chr13&o=95361878&l=95361878&r=95364389&db=hg19

　　2. 往下拉，點(diǎn)這個(gè)地方：Genomic Sequence from assembly，就來(lái)到如下頁(yè)面：

　　http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=htcGeneInGenome&i=NM_007084&c=chr13&l=95361878&r=95364389&o=refGene&table=refGene

　　3. 選擇好上下游長(zhǎng)度，以及其它選項(xiàng)，往下拉，點(diǎn)submit:

　　你試試看。追問(wèn)能加下QQ說(shuō)么？我QQ402758327追答沒(méi)有用過(guò)QQ。

如何在NCBI上尋找果蠅的所有基因名稱(chēng)，并下載。

建議直接看ncbi 網(wǎng)站說(shuō)明。知道序列號(hào)就可以輕松找到該基因了。一個(gè)序列號(hào)一般對(duì)因一個(gè)基因呀 ！也可用序列隊(duì)序列比對(duì)法直接找一下

我英文不好，誰(shuí)能教下怎么從NCBI上下載真核原核生物基因序列，具體點(diǎn)

打開(kāi)NCBI網(wǎng)站知，在search中選擇Nucleotide核酸序列，后面輸入你想找序列的拉丁文，搜索,點(diǎn)擊道序列，選著fasta格式，在上方中間位專(zhuān)置send選擇file,create file 就下載下來(lái)了，可以屬以記事本格式打開(kāi)

GenBank Release146(http://www.ncbi.nih.gov/Genbank/)基因序列怎么下載的

首先，你的網(wǎng)址就不zhidao對(duì)，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/其次，選擇數(shù)據(jù)庫(kù)，輸入你版的基因編號(hào)，搜索，然后下載權(quán)。追問(wèn)這個(gè)

Release146

怎么下的？

從ncbi下載的全基因組序列壓縮包是FNA格式 不能解壓怎么辦

通常下載基因組序列是fasta或者text格式，用電腦自帶的筆記本軟件就能打開(kāi)，沒(méi)見(jiàn)過(guò)下載壓縮包這么麻煩的。

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