根據(jù)需要從一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)中搜集對(duì)象的相關(guān)數(shù)據(jù)集合而成的就是二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。像genebank,EMBL這種都是不加選擇的一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù),只要是實(shí)驗(yàn)獲得的,不管什么東西的序列,哪怕是不完整的序列都能上傳,而且它們的數(shù)據(jù)也有可能有重復(fù)。如...
常用的有microRNA數(shù)據(jù)庫(kù)miRBasePDB、NDB數(shù)據(jù)庫(kù),tRNA數(shù)據(jù)庫(kù),以及你想要的其他種類(lèi)的RNA數(shù)據(jù)庫(kù)。其中PDB、NDB數(shù)據(jù)庫(kù)比較權(quán)威,可靠性較高,也比較全面
一般來(lái)說(shuō)所用的分析工具有在線跟下載的下面簡(jiǎn)要列舉一些常用在線軟件的使用1、使用VecScreen工具,分析下列未知序列,輸出序列長(zhǎng)度、載體序列的區(qū)域、可能使用的克隆載體都有哪些。一、步驟:打開(kāi)google首頁(yè),搜索VecScreen,進(jìn)...
生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的主要數(shù)據(jù)類(lèi)型有哪些的呢?這些數(shù)據(jù)的類(lèi)型估計(jì)都是一些講述生物的種類(lèi)、特性、生長(zhǎng)、發(fā)育和再生等。
數(shù)據(jù)庫(kù)(Database)是按照數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)來(lái)組織、存儲(chǔ)和管理數(shù)據(jù)的倉(cāng)庫(kù),一般安裝在服務(wù)器上的。
收集,維護(hù),生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)可以分為4大類(lèi):即基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸和蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)、生物大分子三維空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)。
首先可以拿這個(gè)序列做blastn和blastx,在NCBI網(wǎng)站上:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi;根據(jù)blastn或者blastx的結(jié)果,根據(jù)序列比對(duì)結(jié)果判斷這個(gè)DNA序列是編碼蛋白質(zhì)的基因還是其他的類(lèi)型的DNA;如果是編碼蛋白質(zhì)的...
incellanddevelopmentalbiology屬于生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)可以分為一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)和二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)都直接來(lái)源于實(shí)驗(yàn)獲得的原始數(shù)據(jù),只經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)單的歸類(lèi)整理和注釋?zhuān)欢?jí)數(shù)據(jù)庫(kù)是在一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和...
NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)相似性搜索——核酸序列與核酸數(shù)據(jù)庫(kù)比較(BLASTN)蛋白質(zhì)序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中蛋白質(zhì)序列比較(BLASTP)兩序列比對(duì)(Aligntwosequences)DNA序列分析——ORFFinder(www....
是因?yàn)榻⒑屯晟茢?shù)據(jù)_能夠促進(jìn)生物信息學(xué)的發(fā)展。生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、處理、存儲(chǔ)、傳播,分析和解釋等各方面的學(xué)科,也是隨著生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的迅猛發(fā)展,生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)相結(jié)合形成的一門(mén)...