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氣泡圖生信相關(guān)問答

ggplot2繪制Pathway富集分析氣泡圖
這是參考以下教程用自己的數(shù)據(jù)實現(xiàn)一遍，R語言ggplot2畫圖系列——Pathway富集分析氣泡圖-生信技能樹-PoweredbyDiscuz!http://www.biotrainee.com/forum.php?mod=viewthread&action=printable&tid=927R語言ggplot2...
ATAC-seq專題---生信分析流程
homer分析motif的原理及結(jié)果參見:http://homer.ucsd.edu/homer/motif/index.html根據(jù)motif與已知轉(zhuǎn)錄因子的富集情況可以繪制氣泡圖,從而可以看到樣本與已知轉(zhuǎn)錄因子的富集顯著性。差異peak代表著比較組合染色質(zhì)開放性有差異的位點,ChIP-se...
富集分析第二彈
上圖是氣泡圖形式，由于GO有三個互不交集的ontology本體，所以要單獨分區(qū)展示。氣泡圖比柱狀圖可以多展現(xiàn)1個維度，在上圖中，體現(xiàn)了4個維度信息：（1）氣泡表示分類條目（2）氣泡大小表示基因/基因產(chǎn)物數(shù)量。（3）增加了p-...
【R畫圖】GOplot
富集分析是生信中最常見和常用的一種手段，不管是pathway還是GO。展示形式也是五花八門，比如我們自己最常用的就是氣泡圖。最近看到一些其它的展示方式，用GOplot包畫的，如下：看上去，好像還挺好看，所以順手測試學習了一下。
R語言繪圖(ggplot2、ggpubr)從入門到精通04--柱狀圖美化之調(diào)色_百度知 ...
本次課程所用的配套書籍是：《RGraphicCookbooks》除了以上的基本圖形外，師兄還會給大家講解箱線圖、提琴圖、熱圖、火山圖、氣泡圖、?；鶊D、PCA圖等各種常用的生信圖形的繪制，還不趕緊加入收藏夾，跟著師兄慢慢學起來...
非模式生物GO、KEGG富集分析
一個基因可能具備多個GOterm，一個基因也可能參與多個通路，與之相對應(yīng)的有多個map號這個案例中背景基因文件構(gòu)建思路如下圖3、描述文件跑完之后就會得到一些結(jié)果：生成一些簡單的氣泡圖，條形圖，GO二級分類圖...
R語言繪圖(ggplot2、ggpurb)從入門到精通06--柱狀圖美化之寬度調(diào)節(jié)_百 ...
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R語言繪圖(ggplot2、ggpubr)從入門到精通05--柱狀圖美化之分組修改...
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R語言繪圖從入門到精通07--柱狀圖美化之如何加標簽
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