樓主在選擇Y subcoclumns for replicates or error bars 下的第三個enter and plot error values already calculated elsewhere ,enter中選擇mean,SD,N即可
QPCR實驗得到了相關(guān)的數(shù)據(jù)可以利用GraphPad Prism軟件分析QPCR數(shù)據(jù),這是一個十分好的辦法。
方法
下載安裝GraphPad Prism軟件。
選擇Y subcoclumns for replicates or error bars 下的第三個enter and plot error values already calculated elsewhere ,enter中選擇mean,SD,N即可 1. 首先把你的數(shù)據(jù)在Excel 中按以下方式排列: 第一列, 藥物濃度要換算成log值, 第二列, 與第
在電腦上打開GraphPad Prism軟件,會彈出對話框welcome to GraphPad Prism,點擊左邊的Column,選擇右邊的choose a graph第一排的第四個柱形圖。然后點擊右下角的Create。
graphpad prism 6是最新版的醫(yī)學(xué)繪圖統(tǒng)計軟件,一般搜索因上都有g(shù)raphpad prism 5,如果想體驗新功能的不防試試graphpad prism 6。 graphpad prism 6基于生物統(tǒng)計,曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體,可以制作出非常專業(yè)的醫(yī)學(xué)表。
接著你在ABCD等等那一排的下面的空白框中輸入你的實驗分組報告(比如Control,Sample組之類的,以Control組和EAE組為例)。
有些軟件是可以代替的,這個好象沒有百度搜索Graphpad prism7.0軟件下載,彈出如下網(wǎng)頁。選擇第一條,點擊進點擊如下鏈接下載下載完畢,得到如圖所示壓縮包,解壓縮開始準備安裝。 點擊prism應(yīng)用程序,開始安裝軟件在serial number那一欄輸入如
往實驗分組對應(yīng)的下方添加你的QPCR實驗數(shù)據(jù)。點擊Graphs底下的Data-1。會彈出你的實驗結(jié)果柱狀圖。
GraphPad Prism 5 怎樣在圖表中加入標準差 2010-11-30 19:35 eardo | 分類:常見 如題。最好是能做成 ±xx 這種形式的標準差
將X-title刪掉,Y-title改成QPCR的Relative Expression,把Data-1改成你設(shè)計的引物,比如occludin。
這種情況需要再多列出一列frequency 填上死亡數(shù)目,然后選擇數(shù)據(jù)-加權(quán)-將frequency加權(quán)
點擊左上方Analysis下面的Analyze。會彈出Analyze Data的對話框。將Column analyses下面改成t test(and nonparametric tests),點擊OK出現(xiàn)新對話框,再點擊OK,出現(xiàn)新對話框,上面顯示p value summary為三顆星。
兩組連續(xù)變量的比較是臨床科研中經(jīng)常遇見的問題,比如比較試驗組和對照組的年齡是否相同。對于此類數(shù)據(jù)的分析,首先應(yīng)看再試驗設(shè)計上是否進行了配對,之后再看數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布,方差是否齊。對于此類數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù),大致可以遵循圖1所示的原則。
返回屬性圖數(shù)據(jù)。點擊左邊的Graphs下面的Data 1,點擊最上面的Draw下面橫線,選擇橫線,點擊Write下面的黑體字T,在橫線上面標記星號或者ns即可。就返回了屬性圖數(shù)據(jù)。
Standard Error of Mean 標準誤,即樣本均數(shù)的標準差,是描述均數(shù)抽樣分布的離散程度及衡量均數(shù)抽樣誤差大小的尺度,反映的是樣本均數(shù)之間的變異。標準誤不是標準差,是多個樣本平均數(shù)的標準差。 標準誤用來衡量抽樣誤差。
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怎樣應(yīng)用graphpad prism5統(tǒng)計兩組數(shù)據(jù)
Standard Error of Mean 標準誤,即樣本均數(shù)的標準差,是描述均數(shù)抽樣分布的離散程度及衡量均數(shù)抽樣誤差大小的尺度,反映的是樣本均數(shù)之間的變異。標準誤不是標準差,是多個樣本平均數(shù)的標準差。 標準誤用來衡量抽樣誤差。
graphpad prism分析WB條帶
打開Image J軟件導(dǎo)入WB條帶圖片:File→Open→找到WB條帶把圖片轉(zhuǎn)化成灰度圖片:Image→Type→8-bit。消除圖片背景的影響:Process→Subtract Background,在彈出的對話框中,填上50基本就可以了,并勾上Lightbackground,點擊OK。此時圖片背景會變白一些。設(shè)置定量參數(shù):Analyze→Set Measurements。在彈出的對話框中勾選Area、Mean grayvalue、Min& max gray value、Integrated density。設(shè)置單位:Analyze→Set Scale。在彈出的對話框“Unit of length”后面填上“pixels”,其他的不用改動。把WB圖片轉(zhuǎn)換成亮帶:Edit →Invert選擇菜單欄下的不規(guī)則圓形工具,將圓圈手動拉倒第一條帶,并盡量將條帶都圈起來。點擊菜單欄Analyze下拉出現(xiàn)的measurement,即可彈出你選定區(qū)域的灰度統(tǒng)計值。也可以點擊快捷鍵英文狀態(tài)下的鍵盤m手動移動不規(guī)則圓圈至下一條條帶,重復(fù)8、9步驟,直至所有條帶都被測量當測定完所有條帶,選結(jié)果中的“Edit”的“Select All”,然后復(fù)制數(shù)據(jù)“IntDen”到Excel表即可進行分析。也可以直接在Results對話框中,選擇File →Saveas,直接導(dǎo)出excel表格在excel表格中將目的蛋白的灰度值除以內(nèi)參蛋白的灰度值,進行歸一化處GraphpadPrism軟件中作柱狀圖。
如何使用graphpad做頻數(shù)分布圖
步驟 : 1. 打開 graphpad prism 5 ,出現(xiàn)以 下界面 2. 選擇 需要做的圖 : New table& graph 處選擇 XY ,Choose a graph 處選擇相應(yīng)的圖形(散點圖可選擇第一個或帶有連線的第二個)在 在 Subcolumns for replicates or error values 處選擇(如果只有一個 x 值對應(yīng)一個 y 值,則選擇 Enter and plot a single Y value for each point ,如果有多個 X 值對應(yīng)多個 個 Y 值 (如同一濃度或同一時間點不同組別各個體的 Y 值) 則選擇圖中的圖標) 3. 輸入數(shù)據(jù) (可參照下圖) 4. 查看圖形 點擊 graphs 中的 Data1 則出現(xiàn)以下圖形: 5. 對數(shù)據(jù)進行分析,對圖形進行擬合 XY 中可供選擇的分析種類有 選擇 上圖中中 工具欄中 Analyze data 選項,GraphPad prism5 會自動給出分析選項,Linear regression 可給出 X、 、Y 值的相關(guān)性 r2。 。Nonlinear regression 分析時,應(yīng)先對數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)換( 可選擇 下圖中的 transform 選項) ,將 X 值轉(zhuǎn)換為對數(shù)格式后方可進行 EC50 、IC50 的分析及曲線擬合。 柱狀圖作圖分析步驟: Grouped 作圖步驟: 雙因素(不同藥物不同時間點) 1. 打 開 graphpad prism 5 “ , 選 擇 “ Grouped ” ( 可 用 分 析 方 法 有) 2. 選擇相應(yīng)的圖形格式 一般選擇 下圖中的選項(可將實驗中的諸如每組的濃度、反應(yīng)結(jié)果輸入) 3. 輸入數(shù)據(jù) 可選擇在列表頭輸入不同的治療方式或不同的藥物濃度題名,在行輸入不同時間點及不同時間點各組對應(yīng)的數(shù)值。 見下圖 4. 查看 GraphPad prism5 自動生成的圖形按照下面截圖中 Graph 中與數(shù)據(jù)表相對應(yīng)的名稱(圖中為黑色粗體字) 即可查看 得到的圖形如下: 5. 對數(shù)據(jù)進行分析,并在圖上進行標識 中 選擇下圖中工具欄中 Analyze 選項,GraphPad prism5 會自動給出分析選項,擇 選擇 Two-way ANOVA 可比較實驗結(jié)果在不同時間點、不同組別之間有無差別 ,選擇 Row means/totals, 可給出每個時間點每組的平均值,SEM 及 及 n 值。 6. 在圖形上添加相應(yīng)的字母、 圖標或 或 word 、excel 表: 在柱形圖上右擊鼠標,選擇 insert text 可添加字母或符號如* ,選擇 insert object 可選擇相應(yīng)的選項添加 word 、excel 表。 Column 單因素柱狀圖 1. 打開 graphpad prism 5 ,選擇“Grouped ”(可用分析方法有 2. 選擇相應(yīng)的圖形格式 3. 輸入數(shù)據(jù) 4. 查看 GraphPad prism5 自動生成的圖形按照下面截圖中 Graph 中與數(shù)據(jù)表相對應(yīng)的名稱(圖中為黑色粗體字)即可查看 得到圖形如下: 5. 對數(shù)據(jù)進行分析 選擇下圖中工具欄中 Analyze 選項,GraphPad prism5 會自動給出分析選項,column 提供了正態(tài)分布檢驗、t 檢驗、單因素方差分析等分析選項
如何graphpad prism 分析生物數(shù)據(jù)
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